公路工程监理公司在对路基部分进行监理时，应该重点关注以下几个方面：

1.勘察设计的实施情况：监理人员应该仔细了解勘察设计的大体情况，特别是工程地质情况、地下水位、土层性质等重要参数的测量结果，并监督施工方是否依据勘察设计进行施工。

2.现场施工过程的监督：监理人员应该随时到达施工现场观察，并对现场施工过程进行监督，包括工程量、质量、安全等各方面的要求的符合情况。

3.工程进度的监控：监理人员应该根据施工计划对工程进度进行监控，确保施工周期和提前完成阶段目标。

4. 现场质量检验：监理人员应该对路基工程施工过程进行现场检验，检查并验收土方工程的质量。

5. 工作报告的评估：监理人员应该审核工程单位场部人员的工作报告，做好监理记录，对施工方的工作进行评估并提出整改意见。

总之，对公路工程中的路基部分进行监理，要对勘察、设计、现场施工、工程进度、工程质量等方面进行综合监管，以确保工程的质量、进度、安全和有效性的实现。